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021-65232515
綿羊痘(SPPV)、山羊痘病毒(GTPV)和牛結節性皮膚病病毒(LDSV)核酸檢測試劑
(熒光PCR法,外源內標)
包裝規格:48 T/盒
產(chǎn)品說(shuō)明:
采用Taqman探針技術(shù),以羊痘病毒屬(GaPV)中綿羊痘病毒(SPPV)、山羊痘病毒(GTPV)和牛結節性皮膚病病毒(LDSV)的特異性保守基因為靶位點(diǎn)設計特異性引物和探針,用于樣品中SPPV、GTPV和LDSV核酸的輔助檢測。本產(chǎn)品引入了dUTP / UDG 系統,可降解含U的ssDNA和dsDNA,消除由PCR產(chǎn)物導致的交叉污染。 同時(shí)設置陽(yáng)性?xún)葘φ?(即內標,使用VIC報告基團),通過(guò)檢測內標是否正常來(lái)監測qPCR體系中是否含有 PCR抑制物,避免出現假陰性結果。
產(chǎn)品組成:
組分名稱(chēng) | 主要成分 | DV231Y-21-V1 | |
1 | GaPV PreMix-2 | qPCR反應緩沖液、dNTPs、UDG酶、Taq酶、引物、探針等 | 960 μL/管 |
2 | GaPV陰性對照-2 | 無(wú)酶水 | 400 μL/管 |
3 | GaPV內標對照-2 | 含內標擴增片段的核酸 | 480 μL/管 |
4 | GaPV陽(yáng)性對照-2 | 含目標擴增片段的核酸 | 50 μL/管 |
注:不同批號產(chǎn)品的成分之間不可以混用或互換?。?!
儲存條件和保質(zhì)期:
在-20±5℃避光儲存,有效期12月。干冰運輸。重復凍融小于5次。生產(chǎn)日期,失效日期請見(jiàn)外包裝盒。
適用儀器:
ABI7500、宏石96P、Bio-Rad CFX96實(shí)時(shí)熒光PCR儀等。
樣品要求:
1、適用樣品類(lèi)型
活體或剖檢牛羊的皮膚丘疹、肺部病變組織、淋巴結、血液等樣品。
要求送檢新鮮樣品,禁止反復凍融!
2、樣品處理(核酸提取區)
參照《NY/T 541-2016 獸醫診斷樣品采集、保存與運輸技術(shù)規范》等標準進(jìn)行樣品前處理, 使用商業(yè)化的提取試劑盒提取樣品中的核酸。提取時(shí),每200 μL陰性對照和處理后的樣品溶液中添加10 μL內標對照,提取后的核酸應立即檢測,否則凍存于-20±5℃,保存時(shí)間不超過(guò)6個(gè)月,禁止反復凍融!
*內標對照的其它使用方法:將內標對照混入 qPCR工作液中,但僅僅質(zhì)控擴增過(guò)程和監測qPCR體系中是否含有 PCR抑制物,不能質(zhì)控提取核酸過(guò)程。
檢測方法
為了防止污染,實(shí)驗需分區操作?。?!
注:核酸提取參照樣品要求,在核酸提取區進(jìn)行或在樣品處理區進(jìn)行。
1、試劑準備 (在試劑準備區進(jìn)行)
(1) 推薦方式(內標對照質(zhì)控核酸提取和核酸擴增過(guò)程)
取出試劑盒中的各組分以及自備試劑,室溫放置,待溫度平衡至室溫,混勻后備用;
根據檢測樣品數量,建議每次檢測均設置陰性對照和陽(yáng)性對照。將所需數量(N)的GaPV PreMix-2分配到每個(gè)微離心管(如八連管)中,20 μL/管。待檢樣品數為n時(shí),所需反應數N=樣品數(n)+陽(yáng)性對照(1)+陰性對照(1);
當準備使用時(shí),再轉移到樣品處理區。
(2) 其它方式(內標對照僅質(zhì)控核酸擴增過(guò)程)
根據所檢測的樣品數量按照下表配制反應液,建議每次檢測均設置陰性對照和陽(yáng)性對照。待檢樣品數為n時(shí), 需配制反應體系數N=待檢樣品數(n) +陽(yáng)性對照(1)+陰性對照(1)+1。
*qPCR工作液配制表(其它方式)
組份 | 每反應體積(μL) |
GaPV PreMix-2 | 20 μL×N |
GaPV內標對照-2 | 0.5 μL×N |
*注:本配制方法為在提取樣品核酸未加內標對照時(shí)的補救方法,不推薦。
將配制好的qPCR工作液充分混勻后瞬時(shí)離心,待用;當準備使用時(shí),將等量的20 μL分配到每個(gè)微離心管(如八連管)中,并轉移到樣品處理區。
2、樣品加樣 (在樣品處理區進(jìn)行)
在每個(gè)PCR管中加入5 μL經(jīng)提取的待測樣品和陰性對照、陽(yáng)性對照,蓋上管蓋, 瞬時(shí)離心,使液體全部沉于管底。
3、qPCR擴增 (在擴增與分析區進(jìn)行)
(1) 熒光通道選擇
熒光基團選擇FAM通道檢測GaPV;選擇VIC 通道檢測內標;淬滅基團設置為none。如ABI qPCR儀,還需設置Passive Reference為none。其它儀器參考儀器說(shuō)明書(shū)。
(2) qPCR擴增程序設置
設置反應體系為25 μL。
步驟 | 溫度 | 反應時(shí)間 | 循環(huán) | |
UDG消化 | 50℃ | 5 min | 1 | |
預變性 | 95℃ | 30 sec | 1 | |
擴增 | 變性 | 95℃ | 5 sec | 45 |
退火與延伸 | 60℃ | 35 sec,數據收集 |
4、結果分析 (以ABI7500 qPCR儀為例)
反應結束后,qPCR儀將自動(dòng)生成結果。若儀器自動(dòng)生成的擴增曲線(xiàn)或閾值線(xiàn)有異常,用戶(hù)可根據實(shí)際情況自行調整,基線(xiàn)Start值可以在 3~10,基線(xiàn)End值可設在 5~20,調整各擴增曲線(xiàn)的基線(xiàn)區相對水平即可。點(diǎn)擊Analyze 進(jìn)行分析。
5、質(zhì)量控制
試劑盒中各控制項應符合下列要求,否則實(shí)驗無(wú)效。
陽(yáng)性對照 | 陰性對照 | |
FAM通道(GaPV) | Ct≦32 | 無(wú)Ct值或Ct>40 |
VIC通道 (內標) | 無(wú)Ct值或Ct>40 | 典型的S形曲線(xiàn),Ct≦35 |
參考qPCR工作液配制表(其它方式)配制時(shí),陽(yáng)性對照的VIC通道應均出現S型曲線(xiàn),Ct值≦35。
檢驗結果的解釋
(1)若樣品的VIC通道呈典型的S形曲線(xiàn)且Ct≦35時(shí),
A. 當FAM通道Ct≦35,判定為GaPV陽(yáng)性;
B. 當FAM通道Ct值在35到40之間時(shí),需要觀(guān)察靶基因的擴增曲線(xiàn)是否呈S形,如果曲線(xiàn)呈S形,樣品應視為疑似GaPV陽(yáng)性,需重新檢測;復測結果若Ct值≦40且具有典型S形曲線(xiàn),判定為GaPV陽(yáng)性;反之若為無(wú)Ct顯示、Ct>40或無(wú)典型S形曲線(xiàn),則判定為GaPV陰性。
C. 當FAM通道Ct>40,判定為GaPV陰性。
(2)如果VIC通道的Ct值高于35,而沒(méi)有顯示明顯的S形擴增曲線(xiàn),原因如下:
1) 樣品中存在PCR抑制劑,建議實(shí)驗前稀釋模板。
2) 核酸提取操作存在缺陷,建議重復核酸提取進(jìn)行檢測。
3) 在處理過(guò)程中沒(méi)有獲得合格的樣品,或者在運輸和儲存過(guò)程中樣品已經(jīng)降解,建議重新采樣。
檢驗方法的局限性
1) 陰性結果可能是由于從樣品中提取的核酸質(zhì)量低,儲存條件不當,儲存期不合適,樣品中存在抑制劑,核酸降解和核酸提取方法的提取效率差等原因。
2) 不合理的樣品采集、運送與保存條件,樣品中病毒含量過(guò)低,或不合理的實(shí)驗操作和環(huán)境很可能造成假陰性或假陽(yáng)性結果。其它臨床觀(guān)察和相關(guān)資料應結合測定,必要時(shí)再次進(jìn)行檢測。
3) 由于突變或其它原因,靶序列的序列變化可能會(huì )產(chǎn)生假陰性結果。
注意事項:
1) 本產(chǎn)品僅用于科研使用,使用前請仔細閱讀本說(shuō)明書(shū)。
2) 實(shí)驗前請熟悉和掌握需使用的各種儀器的操作方法和注意事項,對每次實(shí)驗進(jìn)行質(zhì)量控制。
3) 實(shí)驗室管理需嚴格遵照PCR基因擴增實(shí)驗室的管理規范,實(shí)驗人員必須進(jìn)行專(zhuān)業(yè)培訓,實(shí)驗過(guò)程嚴格分區進(jìn)行, 所有消耗品僅作一次性使用,實(shí)驗操作的每個(gè)階段使用專(zhuān)用儀器和設備,各區各階段用品不可交叉使用。
4) 所有檢測樣品均視為具有傳染性的物質(zhì),實(shí)驗過(guò)程中穿工作服并經(jīng)常更換手套,以避免樣品間的交叉污染;
5) 樣品操作、廢棄物處理應符合相關(guān)法規要求:《微生物生物醫學(xué)實(shí)驗室生物安全通用準則》和《醫療廢物管理 條例》。
6) 所有試劑 (包括本產(chǎn)品中的組分與客戶(hù)自備試劑) 使用前均需徹底化凍、混勻。
7) 血液類(lèi)樣品溶血嚴重時(shí),會(huì )使擴增曲線(xiàn)高度顯著(zhù)下降。因此,當使用該試劑盒同時(shí)檢測血液樣品原液和生理鹽水稀釋 樣品時(shí),建議對2類(lèi)模板分別設置不同的閾值線(xiàn),以保證結果的準確性。
8) 當出現多個(gè)樣品的Ct值>40時(shí),可能是qPCR儀自動(dòng)生成的閾值線(xiàn)較高的原因,建議將閾值線(xiàn)高度設置在擴增曲線(xiàn) 最大熒光值的1/15左右后,重新分析。
本產(chǎn)品僅供科研使用,檢測結果不能用作臨床診斷判斷唯一依據
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