平行反應監測技術(shù)（PRM） 實(shí)驗服務(wù)

產(chǎn)品型號：

所屬分類(lèi)：蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗

產(chǎn)品時(shí)間：2024-08-18

簡(jiǎn)要描述：提供商: 上海研謹生物
服務(wù)名稱(chēng): 平行反應監測技術(shù)（PRM） 實(shí)驗服務(wù)
服務(wù)： 1-2周
規格: 實(shí)驗服務(wù)
價(jià)格： 500元
歡迎咨詢(xún)詳談，我們會(huì )根據您的方案及需求制定詳細的服務(wù)協(xié)議。
更多實(shí)驗技術(shù)服務(wù)請瀏覽網(wǎng)站其他內容,或來(lái)電詳詢(xún)!

聯(lián)系我們 在線(xiàn)咨詢(xún)

平行反應監測技術(shù)(PRM) :

PRM是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監視技術(shù)，能夠對目標蛋白質(zhì)、目標肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測，從而實(shí)現對目標蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行定量。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為代表的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先

利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子,隨后在Collision cell中對母離子進(jìn)行碎裂，后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內的所有碎片信息。這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行準確地特異性分析。

實(shí)驗意義:

PRM技術(shù)是針對無(wú)抗體蛋白的驗證新技術(shù)，用于label free, iTRAQ, TMT, SILAC等相對定量蛋白質(zhì)組數據的驗證，或對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)進(jìn)行靶向定量分析。

實(shí)驗步驟:

用PRM進(jìn)行蛋白質(zhì)組數據驗證的一般步驟為:

結果展示

實(shí)驗完成周期及交付標準:

1.實(shí)驗周期: --般PRM時(shí)間為: 5-10天

2.交付標準:

組學(xué)驗證:

①主要儀器、試劑和實(shí)驗方法。

②PRM目標離子信息:肽段序列和定量子離子。

③方法學(xué)重復性評價(jià):三次技術(shù)重復的色譜峰面積相對標準偏差(RSD) (預實(shí)驗結果) 。

④實(shí)驗結果:二級圖譜，XIC圖譜,原始峰面積強度值，矯正后的相對表達量，兩組樣本間的相對比值，ttest p值。

相對/定量:

①主要儀器、試劑和實(shí)驗方法。

②PRM目標離子信息:肽段序列和定量子離子。

③方法學(xué)評價(jià):相對定量的重復性評價(jià)-測試樣本的三次技術(shù)重復的色譜峰面積相對標準偏差(RSD) (預實(shí)驗結果) ;

定量的方法學(xué)評價(jià)-標準品XIC圖譜，LOD， LOQ,線(xiàn)性范圍， 6個(gè)稀釋梯度得到的標準曲線(xiàn)及線(xiàn)性公式(每個(gè)稀釋度有3次技術(shù)重復)。

④實(shí)驗結果:

相對定量:二級圖譜，XIC圖譜,原始峰面積強度值，矯正后的相對表達量，兩組樣本間的相對比值，ttest p值。

定量:二級圖譜，XIC圖譜,原始峰面積強度值，根據標準曲線(xiàn)計算得到的蛋白質(zhì)濃度值，兩組樣本間的相對比值，ttest p值。

需確認的信息:

1.樣品:

①如果樣品為蛋白質(zhì)溶液，蛋白質(zhì)總量≥300mg;

②如果是組織樣品，樣品總量≥0.1g;如果是細胞樣品，細胞數量≥107個(gè);

③如果是體液樣品，血清≥200ml，腦脊液≥200ml, 尿液≥1ml,淚液≥1ml。

2.樣品采集過(guò)程中使用到塑料制品時(shí)，盡量使用無(wú)色產(chǎn)品，以減少塑料制品中雜質(zhì)對質(zhì)譜檢測的影響。

文獻參考

[1] Navin Rauniyar. Parallel Reaction Monitoring: A Targeted Experiment Performed Using High Resolution and HighMass Accuracy Mass Spectrometry. IntJ Mol Sci. 2015 Dec; 16(12): 28566- -28581.

實(shí)驗代做服務(wù)：